31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1319 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1319  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
184 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0873939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4729  inner membrane protein YagU  45.2 
 
 
183 aa  164  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00246  conserved inner membrane protein  45.31 
 
 
204 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00249  hypothetical protein  45.31 
 
 
204 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0333  hypothetical protein  45.31 
 
 
204 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.787826  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0313  hypothetical protein  45.31 
 
 
204 aa  162  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0362655  hitchhiker  0.00720742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3332  hypothetical protein  45.31 
 
 
204 aa  162  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.945018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0298  hypothetical protein  45.31 
 
 
204 aa  162  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3317  protein of unknown function DUF1440  44.79 
 
 
204 aa  161  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4657  inner membrane protein YagU  44.26 
 
 
185 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4667  inner membrane protein YagU  44.26 
 
 
185 aa  160  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.1888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3212  protein of unknown function DUF1440  41.36 
 
 
204 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.269877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2282  hypothetical protein  40.84 
 
 
208 aa  155  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0429  hypothetical protein  41.67 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0508  protein of unknown function DUF1440  41.15 
 
 
204 aa  150  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3478  protein of unknown function DUF1440  42.77 
 
 
180 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0166  hypothetical protein  41.57 
 
 
164 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0171  hypothetical protein  41.57 
 
 
164 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1474  hypothetical protein  40.64 
 
 
198 aa  127  7.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0766  hypothetical protein  38.04 
 
 
164 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0851  hypothetical protein  36.31 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0911  hypothetical protein  37.27 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0463  hypothetical protein  40.24 
 
 
167 aa  107  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00263232  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0041  membrane protein, putative, degenerate  78.69 
 
 
93 aa  106  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0105  periplasmic/secreted protein  34.23 
 
 
179 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000252803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1837  periplasmic/secreted protein  37.13 
 
 
170 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000159853  normal  0.231826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1743  periplasmic/secreted protein  34.44 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0487  periplasmic/secreted protein  35.76 
 
 
179 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0671981  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0040  inner membrane protein YagU  84.78 
 
 
49 aa  84.7  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.106112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0596  hypothetical protein  30.57 
 
 
183 aa  72  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1879  hypothetical protein  28.75 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>