162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1738 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1666  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1738  twin arginine translocase protein A  100 
 
 		 71 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3989  twin arginine translocase protein A  62.5 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03840  twin arginine translocase protein A  68.33 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3375  twin arginine translocase protein A  53.33 
 
 		 76 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  50.85 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  49.28 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  49.28 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0116  twin arginine translocase protein A  49.23 
 
 		 73 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0814  twin arginine translocase protein A  47.14 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.514575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2942  twin arginine translocase protein A  56.86 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3100  twin arginine translocase protein A  55 
 
 		 73 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1053  twin arginine translocase protein A  46.15 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3237  twin arginine translocase protein A  46.27 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1435  hypothetical protein  42.25 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0258  twin arginine translocase protein A  60 
 
 		 72 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0612508  hitchhiker  0.00415205 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2982  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2703  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3682  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.759225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3534  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36939  normal  0.426161 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2671  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0363  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0354  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0436  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.510795  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3250  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1799  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3655  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3713  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2754  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 77 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0415  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00507108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0339  twin arginine translocase protein A  54.9 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.11873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3549  twin arginine translocase protein A  53.85 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475634  hitchhiker  0.000865371 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5554  twin arginine translocase protein A  49.3 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.80239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0781  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0308647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0744  twin arginine translocase protein A  52.63 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0632356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0409  twin arginine translocase protein A  51.92 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2748  twin arginine translocase protein A  49.18 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0542  twin arginine-targeting protein translocase  55.32 
 
 		 54 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0706  twin arginine translocase protein A  48.21 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.121051  normal  0.444547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1180  twin arginine translocase protein A  50.98 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  38.57 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  38.57 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  38.57 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  38.57 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  38.57 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  35.21 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  51.02 
 
 		 73 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  42.31 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  37.33 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  34.67 
 
 		 79 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0714  twin arginine translocase protein A  50.98 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407257 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2000  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.238587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 79 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1776  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  37.5 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  37.1 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2303  twin arginine translocase protein A  51.06 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  45.1 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1972  twin arginine-targeting protein translocase  44.83 
 
 		 86 aa  51.2  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  41.18 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  44.9 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  39.34 
 
 		 89 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  44.68 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  32.93 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0701  twin arginine-targeting protein translocase  48.44 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4185  twin arginine-targeting protein translocase  39.39 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2429  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001924  twin-arginine translocation protein TatA  46.81 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0117  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  62.5 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.321462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0382  twin arginine translocase protein A  52.94 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.730968  normal  0.113701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  31.71 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00565  twin arginine translocase protein A  46.81 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  44.23 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  31.71 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  41.79 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0593  twin arginine-targeting protein translocase  39.66 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0778682  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1038  twin arginine-targeting protein translocase  44.68 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.86 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1041  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1143  twin arginine translocase protein A  54 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3420  twin arginine-targeting protein translocase  35.62 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.984089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  46 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1082  twin arginine-targeting protein translocase  44.68 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  44.44 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0913  twin arginine translocase protein A  63.83 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4890  twin arginine translocase protein A  41.89 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  28.79 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>