22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0476 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0476  flavodoxin  100 
 
 
160 aa  334  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0539  flavodoxin  98.12 
 
 
160 aa  327  4e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02899  flavodoxin  62.5 
 
 
164 aa  192  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2294  flavodoxin  55.48 
 
 
154 aa  161  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.365351  normal  0.133719 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  34.53 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  34.53 
 
 
147 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  33.81 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  35.04 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  29.09 
 
 
147 aa  51.6  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  22.14 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  29.13 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  27.52 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  28.74 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  25.66 
 
 
148 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  26.13 
 
 
147 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  28.45 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>