28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0539 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0539  flavodoxin  100 
 
 		 160 aa  333  5.999999999999999e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0476  flavodoxin  98.12 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02899  flavodoxin  62.5 
 
 		 164 aa  193  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2294  flavodoxin  56.13 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.365351  normal  0.133719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1668  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000400583  hitchhiker  1.50261e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3335  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000659666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3300  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.31078e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3250  flavodoxin  34.04 
 
 		 154 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000245665  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3596  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000203482  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3550  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.52439e-45 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3649  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000118678  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3559  flavodoxin  34.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3244  flavodoxin  38.53 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000023193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3555  flavodoxin  33.33 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000142004  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1148  flavodoxin  29.09 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000105619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1095  flavodoxin  29.13 
 
 		 148 aa  44.3  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0576  flavodoxin  27.52 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0699  flavodoxin  25.66 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0539  flavodoxin  26.13 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000706098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2409  protoporphyrinogen oxidase  28.14 
 
 		 181 aa  42  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136205  normal  0.0149961 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3667  flavodoxin, short chain  22.14 
 
 		 148 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0628  flavodoxin  28.45 
 
 		 147 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0056688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004124  flavodoxin 1  26.28 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000570149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1143  flavodoxin  26.92 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0459  flavodoxin  22.37 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.728762  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0566  flavodoxin FldA  28.57 
 
 		 215 aa  40.8  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.83272e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0712  flavodoxin FldA  28.57 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000898248  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0731  flavodoxin FldA  28.57 
 
 		 215 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.8987999999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>