39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0903 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0903  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  314  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1944  Domain of unknown function DUF1918  40.48 
 
 
168 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0473037  normal  0.0224139 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  36.2 
 
 
169 aa  85.5  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0478  hypothetical protein  40.7 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4833  hypothetical protein  43.75 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12325  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3532  hypothetical protein  49.23 
 
 
67 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1101  hypothetical protein  46.38 
 
 
88 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896189  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1112  hypothetical protein  46.38 
 
 
93 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2359  hypothetical protein  47.06 
 
 
69 aa  57.4  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0474172  normal  0.0240528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10579  hypothetical protein  43.48 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4834  hypothetical protein  43.1 
 
 
68 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1559  hypothetical protein  40.26 
 
 
88 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.398033  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5196  hypothetical protein  40.28 
 
 
92 aa  54.7  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.211561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0284  signal-transduction protein  48.28 
 
 
68 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2334  hypothetical protein  53.45 
 
 
63 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0283  hypothetical protein  40.45 
 
 
109 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1558  hypothetical protein  51.72 
 
 
73 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00644222  decreased coverage  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4102  hypothetical protein  46.77 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169381  normal  0.19585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0114  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3764  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1044  hypothetical protein  35.96 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0568279  normal  0.0249493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  41.79 
 
 
242 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1084  hypothetical protein  41.54 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0089148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4258  Domain of unknown function DUF1918  48.48 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2337  hypothetical protein  38.46 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.598725  normal  0.918731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  44.83 
 
 
236 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0285  putative DNA-binding protein  41.38 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12651  hypothetical protein  43.59 
 
 
93 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.55176e-20  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6489  hypothetical protein  47.54 
 
 
63 aa  47.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1414  hypothetical protein  42.86 
 
 
92 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2889  hypothetical protein  39.19 
 
 
88 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0362604  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4452  hypothetical protein  44.83 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3621  Domain of unknown function DUF1918  47.62 
 
 
63 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1645  hypothetical protein  48.28 
 
 
74 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11756  hypothetical protein  32.09 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0215022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2057  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000922275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2457  hypothetical protein  41.54 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000175722  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2733  Domain of unknown function DUF1918  42.42 
 
 
66 aa  42  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>