14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1044 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1044  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0568279  normal  0.0249493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2337  hypothetical protein  60.67 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.598725  normal  0.918731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4833  hypothetical protein  52.81 
 
 		 85 aa  93.6  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0283  hypothetical protein  46.34 
 
 		 109 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0478  hypothetical protein  40.74 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2889  hypothetical protein  41.25 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0362604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1414  hypothetical protein  45.33 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5196  hypothetical protein  39.74 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.211561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1944  Domain of unknown function DUF1918  36.14 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0473037  normal  0.0224139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0903  hypothetical protein  35.96 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11756  hypothetical protein  36.47 
 
 		 153 aa  48.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0215022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12651  hypothetical protein  39.74 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.55176e-20  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  51.02 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1559  hypothetical protein  36.59 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.398033  normal  0.484756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>