29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1558 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1558  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00644222  decreased coverage  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1645  hypothetical protein  74.58 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2359  hypothetical protein  59.42 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0474172  normal  0.0240528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6489  hypothetical protein  56.45 
 
 
63 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0114  hypothetical protein  60.34 
 
 
68 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4452  hypothetical protein  48.48 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3621  Domain of unknown function DUF1918  57.89 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0284  signal-transduction protein  56.9 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2334  hypothetical protein  55.17 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2057  hypothetical protein  53.45 
 
 
63 aa  66.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000922275 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0285  putative DNA-binding protein  57.63 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05040  protein of unknown function (DUF1918)  56.6 
 
 
61 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.372152  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4258  Domain of unknown function DUF1918  51.72 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2733  Domain of unknown function DUF1918  55.77 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  50.85 
 
 
242 aa  61.2  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3532  hypothetical protein  56.9 
 
 
67 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  52.54 
 
 
236 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4102  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169381  normal  0.19585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10579  hypothetical protein  44.78 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1112  hypothetical protein  49.18 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1101  hypothetical protein  49.18 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896189  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  45.76 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4834  hypothetical protein  47.46 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12325  hypothetical protein  46.77 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3764  hypothetical protein  43.1 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0903  hypothetical protein  51.72 
 
 
160 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2457  hypothetical protein  46.77 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000175722  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1084  hypothetical protein  47.37 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0089148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1944  Domain of unknown function DUF1918  45.9 
 
 
168 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0473037  normal  0.0224139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>