24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4258 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4258  Domain of unknown function DUF1918  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3621  Domain of unknown function DUF1918  54.24 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2359  hypothetical protein  52.54 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0474172  normal  0.0240528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6489  hypothetical protein  51.67 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1558  hypothetical protein  51.72 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00644222  decreased coverage  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1645  hypothetical protein  53.45 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2334  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05040  protein of unknown function (DUF1918)  51.79 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.372152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0284  signal-transduction protein  51.61 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12325  hypothetical protein  46.55 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  43.75 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0114  hypothetical protein  45 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4452  hypothetical protein  45 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0903  hypothetical protein  48.48 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2057  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000922275 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10579  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4102  hypothetical protein  48.28 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169381  normal  0.19585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  44.44 
 
 		 236 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1112  hypothetical protein  36.76 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3532  hypothetical protein  45.71 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1101  hypothetical protein  36.76 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896189  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  39.34 
 
 		 242 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0285  putative DNA-binding protein  38.98 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2733  Domain of unknown function DUF1918  37.93 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>