25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3764 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3764  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  135  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3532  hypothetical protein  52.54 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2733  Domain of unknown function DUF1918  46.15 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0284  signal-transduction protein  51.72 
 
 
68 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1101  hypothetical protein  45.45 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896189  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1112  hypothetical protein  45.45 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2334  hypothetical protein  48.44 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10579  hypothetical protein  47.46 
 
 
88 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0285  putative DNA-binding protein  43.1 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  40.98 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6489  hypothetical protein  43.75 
 
 
63 aa  52.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1558  hypothetical protein  43.1 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00644222  decreased coverage  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1084  hypothetical protein  43.55 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0089148  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1645  hypothetical protein  44.64 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253255  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0903  hypothetical protein  43.33 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2359  hypothetical protein  38.33 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0474172  normal  0.0240528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4834  hypothetical protein  38.24 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  41.38 
 
 
242 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4102  hypothetical protein  42.37 
 
 
77 aa  47  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169381  normal  0.19585 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4452  hypothetical protein  46.55 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  39.66 
 
 
236 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2057  hypothetical protein  43.1 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000922275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3621  Domain of unknown function DUF1918  40.62 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12325  hypothetical protein  37.29 
 
 
80 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05040  protein of unknown function (DUF1918)  35.71 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.372152  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>