29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4452 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4452  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  180  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0114  hypothetical protein  75.76 
 
 		 68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1645  hypothetical protein  60.34 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253255  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2057  hypothetical protein  56.9 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000922275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1558  hypothetical protein  48.48 
 
 		 73 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00644222  decreased coverage  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2334  hypothetical protein  53.45 
 
 		 63 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6489  hypothetical protein  54.1 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2359  hypothetical protein  54.39 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0474172  normal  0.0240528 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0284  signal-transduction protein  54.24 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2733  Domain of unknown function DUF1918  56.14 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.697257  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3621  Domain of unknown function DUF1918  50.88 
 
 		 63 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0285  putative DNA-binding protein  42.37 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12325  hypothetical protein  44.83 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05040  protein of unknown function (DUF1918)  46.67 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.372152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  44.26 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10579  hypothetical protein  37.31 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2457  hypothetical protein  46.27 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000175722  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1112  hypothetical protein  39.71 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1101  hypothetical protein  40.3 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896189  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  42.65 
 
 		 236 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4102  hypothetical protein  46.55 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169381  normal  0.19585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4258  Domain of unknown function DUF1918  45 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1084  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0089148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4834  hypothetical protein  37.7 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0903  hypothetical protein  44.83 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3532  hypothetical protein  41.38 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3764  hypothetical protein  46.55 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  40.98 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1944  Domain of unknown function DUF1918  37.5 
 
 		 168 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0473037  normal  0.0224139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>