25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05040 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05040  protein of unknown function (DUF1918)  100 
 
 		 61 aa  124  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.372152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2359  hypothetical protein  62.07 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0474172  normal  0.0240528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3621  Domain of unknown function DUF1918  55.36 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6489  hypothetical protein  54.55 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0148832  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0114  hypothetical protein  53.97 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1558  hypothetical protein  56.6 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00644222  decreased coverage  0.00755279 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2057  hypothetical protein  59.62 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000922275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1645  hypothetical protein  49.18 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0253255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0284  signal-transduction protein  54.72 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4452  hypothetical protein  46.67 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4258  Domain of unknown function DUF1918  51.79 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12325  hypothetical protein  46.67 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2334  hypothetical protein  55.1 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.135764  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4502  signal-transduction protein  50.94 
 
 		 236 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1084  hypothetical protein  46.67 
 
 		 84 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.0089148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1962  hypothetical protein  47.27 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.843602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6938  signal-transduction protein  47.17 
 
 		 242 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.335853 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0285  putative DNA-binding protein  50.94 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.880984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1112  hypothetical protein  45 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1101  hypothetical protein  45 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896189  normal  0.238295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3532  hypothetical protein  58.97 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2457  hypothetical protein  44.07 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000175722  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10579  hypothetical protein  40.32 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4102  hypothetical protein  41.82 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169381  normal  0.19585 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3764  hypothetical protein  35.71 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>