15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3210 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3210  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  869    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2133  hypothetical protein  42.98 
 
 
396 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.695891  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2582  hypothetical protein  43.3 
 
 
367 aa  202  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5235  hypothetical protein  43.79 
 
 
383 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3918  putative exported protein of unknown function  47.02 
 
 
382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3290  hypothetical protein  43.12 
 
 
386 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3147  hypothetical protein  40.35 
 
 
388 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114905  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2180  hypothetical protein  45.19 
 
 
366 aa  153  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3609  hypothetical protein  39.14 
 
 
420 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2632  hypothetical protein  36.07 
 
 
364 aa  136  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593908  normal  0.123743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3960  hypothetical protein  39.36 
 
 
417 aa  118  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2179  hypothetical protein  47 
 
 
161 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0454  hypothetical protein  33.06 
 
 
352 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6019  hypothetical protein  33.06 
 
 
352 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1446  hypothetical protein  29.7 
 
 
356 aa  51.6  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000192739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>