15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3918 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3918  putative exported protein of unknown function  100 
 
 		 382 aa  736    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3290  hypothetical protein  68.06 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2133  hypothetical protein  66.41 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.695891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5235  hypothetical protein  66.12 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2582  hypothetical protein  61.77 
 
 		 367 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3147  hypothetical protein  58.89 
 
 		 388 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2180  hypothetical protein  58.37 
 
 		 366 aa  232  1e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3210  hypothetical protein  43.63 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2179  hypothetical protein  69.64 
 
 		 161 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3609  hypothetical protein  38.46 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3960  hypothetical protein  36.79 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2632  hypothetical protein  31.72 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593908  normal  0.123743 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1446  hypothetical protein  26.7 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000192739  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0454  hypothetical protein  29.95 
 
 		 352 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6019  hypothetical protein  29.35 
 
 		 352 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>