15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3290 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3290  hypothetical protein  100 
 
 		 386 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2133  hypothetical protein  83.59 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.695891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3918  putative exported protein of unknown function  70.17 
 
 		 382 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5235  hypothetical protein  68.47 
 
 		 383 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250261 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2582  hypothetical protein  62.6 
 
 		 367 aa  424  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3147  hypothetical protein  63.27 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2180  hypothetical protein  57.35 
 
 		 366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3210  hypothetical protein  43.05 
 
 		 457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2179  hypothetical protein  64.84 
 
 		 161 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3609  hypothetical protein  36.1 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2632  hypothetical protein  29.84 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593908  normal  0.123743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3960  hypothetical protein  33.92 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0454  hypothetical protein  31.03 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1446  hypothetical protein  26.55 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000192739  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6019  hypothetical protein  40 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>