14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2180 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  721    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.759642 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2582  hypothetical protein  75.54 
 
 		 367 aa  327  3e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.367955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3147  hypothetical protein  57.89 
 
 		 388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5235  hypothetical protein  57.43 
 
 		 383 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2133  hypothetical protein  57.76 
 
 		 396 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.695891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3290  hypothetical protein  55.17 
 
 		 386 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3918  putative exported protein of unknown function  55.6 
 
 		 382 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3210  hypothetical protein  45.73 
 
 		 457 aa  125  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3960  hypothetical protein  38.19 
 
 		 417 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2632  hypothetical protein  35.96 
 
 		 364 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593908  normal  0.123743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3609  hypothetical protein  38.57 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1446  hypothetical protein  30.88 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000192739  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0454  hypothetical protein  28.07 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6019  hypothetical protein  32.98 
 
 		 352 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>