9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3697 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3697  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  478  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.477801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4237  hypothetical protein  39.81 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2824  Type IV secretory pathway TrbF protein-like protein  20.96 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2011  conjugal transfer protein TrbF  24.42 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264252  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2357  conjugal transfer protein TrbF  24.88 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.109686  normal  0.258524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0733  conjugal transfer protein TrbF  25 
 
 		 234 aa  42  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2577  conjugal transfer protein TrbF  24.88 
 
 		 234 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.756433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1557  conjugal transfer protein TrbF  24.64 
 
 		 234 aa  42  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000776204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1289  conjugal transfer protein TrbF  24.89 
 
 		 234 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>