39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1171 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1171  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 45 aa  88.6  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2774  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  84.09 
 
 		 55 aa  74.7  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567495  normal  0.737222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1929  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  71.11 
 
 		 54 aa  70.5  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00573341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3783  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  75 
 
 		 46 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2817  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  74.42 
 
 		 45 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1083  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  84.44 
 
 		 45 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0999  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  84.44 
 
 		 45 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4306  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  83.72 
 
 		 45 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0436263  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  55.56 
 
 		 48 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  53.33 
 
 		 48 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.82 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.82 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  44.44 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  52.27 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.27 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  50 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.45 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2217  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.18 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  47.73 
 
 		 56 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.27 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1991  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2419  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00562529  hitchhiker  0.0000013889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1963  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 65 aa  42  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 59 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2358  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 67 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.62 
 
 		 54 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1797  hypothetical protein  42.86 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275995  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2113  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.110001  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2012  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000291515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.45 
 
 		 51 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1522  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  79.55 
 
 		 45 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0871084  normal  0.991192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2016  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  43.18 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.48 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  43.18 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.27 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.73 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0344  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  50 
 
 		 61 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00994318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>