57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3850 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 51 aa  103  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0541  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60.78 
 
 		 52 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0689  RdxS, cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60.78 
 
 		 52 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122568  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2344  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60.78 
 
 		 52 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.005747  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0668  nitrogen fixation protein fixS  58.82 
 
 		 52 aa  70.1  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2537  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.86 
 
 		 52 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.544754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7464  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  57.78 
 
 		 45 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.06 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6714  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.33 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  61.9 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1841  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  62.75 
 
 		 52 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.752345  normal  0.421653 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5023  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  49.02 
 
 		 52 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  48 
 
 		 49 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 		 74 aa  50.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.98 
 
 		 52 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.06 
 
 		 69 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2571  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.58 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.831521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.76 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52 
 
 		 52 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5928  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.27 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.657419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.92 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2774  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 55 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567495  normal  0.737222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2444  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56 
 
 		 54 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116458  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.94 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.9 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.9 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0008  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  53.33 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1929  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.45 
 
 		 54 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00573341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.81 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.82 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.9 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  39.22 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  42.55 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1226  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.012112  normal  0.558991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  40.43 
 
 		 54 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2256  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0217106  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0737  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.29 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  45.1 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1953  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  31.37 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1795  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56 
 
 		 49 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  36 
 
 		 68 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2817  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 45 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44 
 
 		 48 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0680  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  40 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1370  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  36 
 
 		 54 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.938434  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3783  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.44 
 
 		 46 aa  40  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  43.18 
 
 		 58 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.29 
 
 		 82 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.33 
 
 		 54 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>