89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0712 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  100 
 
 
63 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.25 
 
 
84 aa  77  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.55 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  60 
 
 
58 aa  63.5  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0165  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.9 
 
 
73 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.73 
 
 
59 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  52.08 
 
 
48 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 
48 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  46.3 
 
 
54 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 
59 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 
59 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5919  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.27 
 
 
87 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.662161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1995  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.12 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.407314  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  48.98 
 
 
58 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.68 
 
 
71 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2774  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  55.56 
 
 
55 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567495  normal  0.737222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  44.26 
 
 
68 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  45.1 
 
 
54 aa  54.3  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.98 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1929  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  56.82 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00573341  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3563  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  37.1 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201195  normal  0.576865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2483  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.67 
 
 
61 aa  52.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0591918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2611  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.54 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.38073  normal  0.51835 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4262  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.92 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.336957  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.75 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000072597  normal  0.220817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1606  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.92 
 
 
71 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0765964  normal  0.010544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1791  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.37 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1814  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.88 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.69622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  33.33 
 
 
70 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19940  cbb3-type cytochrome oxidase maturation protein  38.46 
 
 
73 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1815  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  37.7 
 
 
70 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4493  hypothetical protein  41.94 
 
 
71 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2207  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.94 
 
 
71 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.13713  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  41.07 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.94 
 
 
54 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.33 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.98342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3580  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.83 
 
 
70 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2214  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.19 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2164  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.19 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.123278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2220  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.98 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.482957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3827  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.83 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1953  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.68 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44450  hypothetical protein  45.16 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00324047  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0344  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  49.09 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00994318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3784  hypothetical protein  45.16 
 
 
69 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376969  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1874  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.13 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.308145  normal  0.762783 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5324  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  42.31 
 
 
52 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00716612  normal  0.129853 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1797  hypothetical protein  35.59 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275995  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2358  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.33 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0462  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1178  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  41.54 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1370  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  43.64 
 
 
54 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.938434  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2817  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 
45 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1991  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.5 
 
 
61 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3783  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  51.11 
 
 
46 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132842  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2113  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.48 
 
 
66 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.110001  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0946  hypothetical protein  38.98 
 
 
100 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1963  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  37.93 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2012  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.48 
 
 
66 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000291515 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1472  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.98 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0256438  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0772  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.42 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118869  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2217  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.22 
 
 
61 aa  45.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1845  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.71 
 
 
89 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0701  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.72 
 
 
68 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0194484  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1575  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.98 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.33 
 
 
51 aa  45.1  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1156  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.86 
 
 
74 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.0826721 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4955  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.1 
 
 
52 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000981596  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1137  hypothetical protein  33.33 
 
 
55 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0106882  normal  0.952365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02061  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.76 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3323  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  47.62 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0243934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2419  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  34.43 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00562529  hitchhiker  0.0000013889 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1226  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.35 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.012112  normal  0.558991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2394  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  42 
 
 
49 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1238  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.83 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5023  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.15 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.156447  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1340  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.83 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131657  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1525  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  53.49 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2016  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2256  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  35.42 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0217106  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0356  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.9 
 
 
52 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0371  cytochrome oxidase maturation protein, Cbb3-type  44.9 
 
 
52 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.156839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6714  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 
45 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0008  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  39.13 
 
 
59 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7464  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 
45 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2444  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  44.23 
 
 
54 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116458  normal  0.535844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2082  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  36.54 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0680  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3- type  29.82 
 
 
71 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.601638  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2045  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  55.17 
 
 
67 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0103953  normal  0.644275 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>