26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2817 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2817  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 45 aa  85.5  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2774  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  77.78 
 
 		 55 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567495  normal  0.737222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1929  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  79.07 
 
 		 54 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00573341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3783  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  80 
 
 		 46 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0999  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  74.42 
 
 		 45 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1083  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  74.42 
 
 		 45 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.76 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  54.76 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  50 
 
 		 48 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4306  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  71.11 
 
 		 45 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0436263  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.62 
 
 		 48 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  48.89 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  42.86 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 54 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  42.22 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  38.1 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1522  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  77.78 
 
 		 45 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0871084  normal  0.991192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 51 aa  42  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  42.86 
 
 		 54 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  48.89 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  42.86 
 
 		 54 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  42.86 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1052  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2359  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>