32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1083 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0999  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 45 aa  89.7  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1083  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  100 
 
 		 45 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.161674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2774  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  88.64 
 
 		 55 aa  80.1  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.567495  normal  0.737222 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1929  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  77.78 
 
 		 54 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00573341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3783  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  77.27 
 
 		 46 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2817  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  74.42 
 
 		 45 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4306  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  74.42 
 
 		 45 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0436263  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2042  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  48.89 
 
 		 48 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.589343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2045  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  46.67 
 
 		 48 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00305022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1171  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  84.44 
 
 		 45 aa  50.4  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1522  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  84.09 
 
 		 45 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0871084  normal  0.991192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2993  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  52.27 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1196  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.73 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1569  cytochrome oxidase maturation protein (cbb3-t)  50 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.246942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1103  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.73 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0784477  normal  0.590624 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1275  signal peptide protein  45.45 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.695713 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0712  cytochrome oxidase maturation protein cbb3-type  47.73 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720002  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003473  type cbb3 cytochrome oxidase biogenesis protein CcoS involved in heme b insertion  45.45 
 
 		 54 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02297  hypothetical protein  45.45 
 
 		 54 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1364  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  47.73 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.540828 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2067  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2415  secretion protein HlyD  37.78 
 
 		 68 aa  42  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3850  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  43.18 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0452  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  50 
 
 		 58 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0935391  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2113  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.110001  normal  0.234091 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1963  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00735712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2012  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 66 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000291515 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1276  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.45 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2358  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  40.91 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0933  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  38.64 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.177633  normal  0.669398 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1047  cytochrome oxidase maturation protein, cbb3-type  45.24 
 
 		 54 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.372201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1797  hypothetical protein  40.48 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.275995  normal  0.177533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>