15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6332 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  9e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  42.45 
 
 		 160 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  45.53 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  44.72 
 
 		 136 aa  94  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  43.9 
 
 		 136 aa  91.7  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  38.1 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  37.41 
 
 		 179 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  42.66 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  43.17 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  36.03 
 
 		 409 aa  64.3  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  35.04 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  36 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3123  transport-associated protein  41.13 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.355874  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2774  hypothetical protein  40.68 
 
 		 96 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3840  hypothetical protein  34.03 
 
 		 361 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.483504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>