12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1287 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  100 
 
 
136 aa  269  9e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  99.26 
 
 
136 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  97.06 
 
 
159 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  78.95 
 
 
179 aa  202  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  77.44 
 
 
160 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  58.91 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  42.22 
 
 
160 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  43.9 
 
 
164 aa  92  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  42.86 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  38.79 
 
 
409 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  34.09 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  31.58 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>