15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3317 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  100 
 
 
160 aa  307  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  98.12 
 
 
160 aa  301  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3123  transport-associated protein  91.19 
 
 
160 aa  219  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.355874  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  42.86 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  34.56 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  38.24 
 
 
409 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  35.14 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2774  hypothetical protein  48.39 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  35.54 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  35.25 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  36.09 
 
 
179 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3840  hypothetical protein  48.61 
 
 
361 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.483504 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  35.34 
 
 
159 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  35.34 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  34.59 
 
 
136 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>