14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4475 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  323  6e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  44.3 
 
 
159 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  42.22 
 
 
136 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  42.22 
 
 
136 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  40.65 
 
 
164 aa  97.1  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  42.76 
 
 
179 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  42.76 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  40.29 
 
 
156 aa  90.5  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  39.04 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  34.29 
 
 
409 aa  68.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  34.33 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  34.33 
 
 
160 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3123  transport-associated protein  31.34 
 
 
160 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.355874  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3840  hypothetical protein  39.47 
 
 
361 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.483504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>