13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6276 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6276  transport-associated  100 
 
 		 179 aa  350  8e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0105604 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6562  transport-associated  98.75 
 
 		 160 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.677785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6151  transport-associated  79.38 
 
 		 159 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379338  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1287  transport-associated  78.95 
 
 		 136 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.740475  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6544  transport-associated  78.95 
 
 		 136 aa  202  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.483761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5516  transport-associated protein  64.1 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.428699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4475  hypothetical protein  42.48 
 
 		 160 aa  92.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6332  hypothetical protein  37.41 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.24237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3371  cyclase/dehydrase  44.83 
 
 		 409 aa  71.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5032  transport-associated  38.81 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  0.551678 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3231  transport-associated  35.66 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.324384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3317  transport-associated  35.66 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2774  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  41.2  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>