29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5803 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5803  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550246  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5817  hypothetical protein  59.42 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46630  PIN-domain protein  56.06 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0073  PilT domain-containing protein  47.54 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3923  PilT domain-containing protein  49.23 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.547564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5816  hypothetical protein  84.85 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595083  normal  0.267355 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0074  hypothetical protein  72.73 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.908723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46620  hypothetical protein  72.73 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0851  hypothetical protein  70.59 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.631847  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0630  PilT domain-containing protein  45.45 
 
 		 126 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0411  PilT domain-containing protein  38.36 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4802  PilT domain-containing protein  44.44 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.005118  normal  0.0206517 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0697  PilT protein-like protein  48.15 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.305282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6032  toxin of a toxin/antitoxin system  39.68 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0329  PilT protein-like  41.18 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0610  PilT protein-like protein  37.88 
 
 		 122 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4800  PilT protein-like  36.59 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1289  PilT protein domain protein  34.33 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.745821  unclonable  0.0000000000204533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4948  PilT domain-containing protein  39.71 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651261  decreased coverage  0.006546 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1697  hypothetical protein  58.33 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0229  PilT protein domain protein  34.85 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5320  PilT domain-containing protein  39.71 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3046  PilT protein-like  39.71 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0701  nucleic acid-binding protein  38.18 
 
 		 127 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3863  PilT domain-containing protein  34.85 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.418671  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5123  PilT protein domain protein  37.5 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.971488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11136  hypothetical protein  41.82 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1578  PIN domain protein  32.84 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4803  hypothetical protein  54.55 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0192558  normal  0.0179772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>