23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4800 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4800  PilT protein-like  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0610  PilT protein-like protein  56.31 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3046  PilT protein-like  49.52 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454539  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5320  PilT domain-containing protein  49.52 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.617497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4948  PilT domain-containing protein  49.52 
 
 		 123 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651261  decreased coverage  0.006546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0329  PilT protein-like  45.71 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6032  toxin of a toxin/antitoxin system  41.75 
 
 		 123 aa  90.1  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0701  nucleic acid-binding protein  44.55 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1578  PIN domain protein  41.75 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0937354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3923  PilT domain-containing protein  46.81 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.547564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1289  PilT protein domain protein  40.78 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.745821  unclonable  0.0000000000204533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0229  PilT protein domain protein  40.78 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5123  PilT protein domain protein  43.88 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.971488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3863  PilT domain-containing protein  43.33 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.418671  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0697  PilT protein-like protein  47.19 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.305282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0411  PilT domain-containing protein  42.16 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0630  PilT domain-containing protein  40.4 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4802  PilT domain-containing protein  38.24 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.005118  normal  0.0206517 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5817  hypothetical protein  40.38 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46630  PIN-domain protein  39.42 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11136  hypothetical protein  39.77 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0073  PilT domain-containing protein  36.73 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5803  hypothetical protein  36.59 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>