More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5576 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5576  aspartate/ornithine carbamoyltransferase carbamoyl-P binding domain protein  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.000178756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2685  ornithine carbamoyltransferase  36.84 
 
 		 336 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.841413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1908  ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 		 331 aa  92.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000351047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0747  ornithine carbamoyltransferase  33.79 
 
 		 333 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0828856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1992  ornithine carbamoyltransferase  34.93 
 
 		 334 aa  92.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4387  ornithine carbamoyltransferase  32.89 
 
 		 336 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.180645 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2091  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 334 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.63428  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0433  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 333 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.776106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2240  ornithine carbamoyltransferase  36.57 
 
 		 333 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.385823  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0520  ornithine carbamoyltransferase  31.33 
 
 		 334 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0374  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.57 
 
 		 335 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002420  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 334 aa  89.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0425  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.57 
 
 		 335 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1976  ornithine carbamoyltransferase  33.78 
 
 		 332 aa  89  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4224  ornithine carbamoyltransferase  32.89 
 
 		 336 aa  89  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2425  ornithine carbamoyltransferase  38.1 
 
 		 334 aa  88.6  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0554  ornithine carbamoyltransferase  34.27 
 
 		 339 aa  87.8  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0999  ornithine carbamoyltransferase  32.21 
 
 		 336 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1037  ornithine carbamoyltransferase  32.21 
 
 		 336 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1107  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7762  normal  0.256568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1000  ornithine carbamoyltransferase  32.21 
 
 		 336 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03645  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 334 aa  87.4  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5912  ornithine carbamoyltransferase  32.89 
 
 		 336 aa  87.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0459  ornithine carbamoyltransferase subunit F  36.64 
 
 		 334 aa  87.4  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0130179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2385  ornithine carbamoyltransferase  34.23 
 
 		 336 aa  86.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0499309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4867  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 334 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02370  ornithine carbamoyltransferase  35.06 
 
 		 331 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.293811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0090  ornithine carbamoyltransferase, catabolic  35.88 
 
 		 331 aa  86.3  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00840  ornithine carbamoyltransferase  35.06 
 
 		 331 aa  86.3  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.96498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4847  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 334 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4811  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 334 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.278589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68340  ornithine carbamoyltransferase  32.89 
 
 		 336 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.246244  normal  0.170592 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4748  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 334 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3732  ornithine carbamoyltransferase subunit I  32.17 
 
 		 338 aa  85.5  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1967  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.9  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.604049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3332  ornithine carbamoyltransferase  35.11 
 
 		 334 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3566  ornithine carbamoyltransferase subunit I  32.17 
 
 		 339 aa  85.1  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0245  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380448  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1146  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2127  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.764905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1586  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1986  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.370878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0914  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 336 aa  85.1  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12594  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2176  ornithine carbamoyltransferase  34.25 
 
 		 332 aa  84.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1390  ornithine carbamoyltransferase  38.21 
 
 		 334 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00030197  normal  0.635885 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4825  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.1 
 
 		 337 aa  84.3  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5775  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.1 
 
 		 334 aa  84.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4734  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.1 
 
 		 334 aa  84  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2799  ornithine carbamoyltransferase  31.51 
 
 		 334 aa  84.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04120  ornithine carbamoyltransferase 1  33.1 
 
 		 334 aa  84  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3758  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.1 
 
 		 334 aa  84  9e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4510  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.1 
 
 		 334 aa  84  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0746684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04084  hypothetical protein  33.1 
 
 		 334 aa  84  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0031  ornithine carbamoyltransferase  31.88 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4647  ornithine carbamoyltransferase  34.33 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4538  ornithine carbamoyltransferase  36.51 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0837196  normal  0.311229 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0450  ornithine carbamoyltransferase  32.19 
 
 		 334 aa  82.4  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.601732  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3684  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.79 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3549  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.79 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1948  ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0387191  normal  0.307808 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1676  ornithine carbamoyltransferase  37.78 
 
 		 339 aa  82  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4042  ornithine carbamoyltransferase subunit I  33.79 
 
 		 335 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06550  ornithine carbamoyltransferase  37.4 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.616964  normal  0.675152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5203  ornithine carbamoyltransferase  31.54 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.789532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6442  ornithine carbamoyltransferase  34.13 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.316397  normal  0.303934 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0162  ornithine carbamoyltransferase  35.51 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0158  ornithine carbamoyltransferase  35.51 
 
 		 331 aa  82.4  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0068  ornithine carbamoyltransferase  31.97 
 
 		 329 aa  81.6  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4829  ornithine carbamoyltransferase subunit I  32.39 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3743  ornithine carbamoyltransferase  32.39 
 
 		 334 aa  81.6  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0929  ornithine carbamoyltransferase  35.77 
 
 		 338 aa  81.6  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142101  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0425  ornithine carbamoyltransferase  29.45 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0182  ornithine carbamoyltransferase  32.82 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf129  ornithine carbamoyltransferase  36.09 
 
 		 347 aa  80.1  0.00000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2126  ornithine carbamoyltransferase  30.77 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5576  ornithine carbamoyltransferase  33.56 
 
 		 332 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4754  ornithine carbamoyltransferase subunit I  34.4 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4872  ornithine carbamoyltransferase subunit I  34.4 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.502026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1876  ornithine carbamoyltransferase  32.88 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4817  ornithine carbamoyltransferase subunit I  34.4 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4724  ornithine carbamoyltransferase subunit I  34.4 
 
 		 334 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.262435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2351  ornithine carbamoyltransferase  32.14 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4853  ornithine carbamoyltransferase subunit I  34.4 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2249  ornithine carbamoyltransferase  31.58 
 
 		 335 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0484  ornithine carbamoyltransferase  30.82 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164308  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1252  ornithine carbamoyltransferase  31.43 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1227  ornithine carbamoyltransferase  31.43 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.149639  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0872  ornithine carbamoyltransferase  28.97 
 
 		 327 aa  74.7  0.0000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00322562  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2165  ornithine carbamoyltransferase  31.69 
 
 		 337 aa  74.3  0.0000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0342  ornithine carbamoyltransferase  31.43 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0704  ornithine carbamoyltransferase  34.11 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0421  ornithine carbamoyltransferase  26.47 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000841393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0473  ornithine carbamoyltransferase  30.71 
 
 		 332 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0421  ornithine carbamoyltransferase  30.71 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0408  ornithine carbamoyltransferase  30.71 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.297743 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1719  ornithine carbamoyltransferase  32.06 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  27.54 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0349  ornithine carbamoyltransferase  30.43 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1646  ornithine carbamoyltransferase  31.3 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2714  ornithine carbamoyltransferase  30.65 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>