22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3387 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  667    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  67.28 
 
 		 330 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  62.54 
 
 		 330 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  50.46 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  47.24 
 
 		 341 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  43.94 
 
 		 332 aa  302  7.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  46.18 
 
 		 333 aa  295  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  42.68 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  40.3 
 
 		 343 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  26.32 
 
 		 331 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  31.69 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 		 1055 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  29.28 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  28.14 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  27.6 
 
 		 365 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  27.24 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  26.07 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  21.38 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  23.78 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3196  hypothetical protein  22.26 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3246  hypothetical protein  22.26 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3184  hypothetical protein  22.26 
 
 		 352 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>