23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3972 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  678    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  67.28 
 
 		 326 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  60.06 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  49.09 
 
 		 331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  46.32 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  42.99 
 
 		 332 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  43.12 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  42.42 
 
 		 348 aa  255  8e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  39.47 
 
 		 343 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  27.85 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 		 1055 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  30.04 
 
 		 331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  27.22 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  26.25 
 
 		 327 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3196  hypothetical protein  25.75 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3246  hypothetical protein  25.75 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3184  hypothetical protein  25.75 
 
 		 352 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  27.63 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  29.01 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  29.24 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  24.19 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  27.45 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4587  hypothetical protein  24.72 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.330538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>