23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0586 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  690    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  67.68 
 
 
332 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  51.38 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  52.24 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  47.75 
 
 
343 aa  333  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  45.45 
 
 
330 aa  301  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  46.18 
 
 
326 aa  295  8e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  43.12 
 
 
331 aa  278  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  43.12 
 
 
330 aa  271  1e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  30.16 
 
 
323 aa  122  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  30.16 
 
 
329 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  28.83 
 
 
331 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  28.23 
 
 
327 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 
1055 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  25.83 
 
 
365 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  25.32 
 
 
333 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  20.61 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  23.84 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3196  hypothetical protein  21.51 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210707  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3246  hypothetical protein  21.51 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3184  hypothetical protein  21.51 
 
 
352 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4587  hypothetical protein  21.58 
 
 
361 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.330538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>