20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5799 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5799  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  714    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.171802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0388  hypothetical protein  60.53 
 
 
348 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.112765  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1097  hypothetical protein  49.54 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0586  hypothetical protein  47.75 
 
 
333 aa  333  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.704758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6848  hypothetical protein  44.44 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2116  hypothetical protein  41.57 
 
 
331 aa  251  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.472836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2370  hypothetical protein  39.76 
 
 
330 aa  249  3e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.124487  normal  0.533699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3387  hypothetical protein  40.3 
 
 
326 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3972  hypothetical protein  39.47 
 
 
330 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0383  hypothetical protein  28.4 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2011  hypothetical protein  27.08 
 
 
331 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.311763  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0857  hypothetical protein  27.49 
 
 
327 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4571  hypothetical protein  24.78 
 
 
345 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0098  hypothetical protein  25.96 
 
 
323 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000701903  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  24.18 
 
 
1055 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1214  hypothetical protein  25 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0245598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2746  hypothetical protein  25.67 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2652  hypothetical protein  25.33 
 
 
333 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1998  hypothetical protein  21.85 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.951695  normal  0.103418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4587  hypothetical protein  22.78 
 
 
361 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.330538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>