44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0960 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  170  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  48.78 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  47.56 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  42.17 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1505  hypothetical protein  47.67 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  44.44 
 
 		 71 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3381  hypothetical protein  43.53 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  37.93 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3218  hypothetical protein  50.94 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  35.8 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  36.71 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1112  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.220285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  34.94 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  35.8 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  39.51 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  31.4 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  37.65 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  36.71 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  43.4 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  35.42 
 
 		 107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  42.35 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  37.21 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  36.27 
 
 		 106 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  36.71 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2791  hypothetical protein  51.43 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  34.62 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  54.29 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2641  hypothetical protein  35.48 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  31.31 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3290  hypothetical protein  30.59 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0343638  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0520  hypothetical protein  34.12 
 
 		 104 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.623296  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  54.29 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  54.29 
 
 		 106 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  54.29 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0495  hypothetical protein  47.62 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  32.5 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>