44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5185 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  91.36 
 
 
94 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  60.49 
 
 
80 aa  100  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  58.23 
 
 
77 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  57.89 
 
 
80 aa  88.2  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  58.23 
 
 
76 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  57.89 
 
 
76 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  54.43 
 
 
103 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  54.43 
 
 
76 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  48.78 
 
 
108 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  46.34 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  35.29 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  37.08 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  38.89 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  31.88 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  35.44 
 
 
93 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  38.96 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  38.96 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  34.44 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  36.23 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  43.75 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  36.9 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0203  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  60 
 
 
225 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3381  hypothetical protein  40.32 
 
 
81 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0960  hypothetical protein  35.71 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  39.06 
 
 
117 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  53.12 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  53.12 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  53.12 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2962  hypothetical protein  27.85 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  53.12 
 
 
105 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  46.15 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0382  hypothetical protein  20.83 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0520  hypothetical protein  53.33 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.623296  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0495  hypothetical protein  53.33 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2791  hypothetical protein  51.52 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227717  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3218  hypothetical protein  42 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.331571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>