35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0660 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  160  8.000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  43.66 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0960  hypothetical protein  39.29 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  41.79 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  35.29 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  40.51 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  34.33 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  34.72 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  35.82 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  35.82 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  35.14 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3381  hypothetical protein  41.03 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  55.81 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  36.62 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  36.49 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  35.82 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0721  hypothetical protein  41.3 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000996835  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3218  hypothetical protein  52.08 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.331571 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  33.77 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  57.5 
 
 		 86 aa  47  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  44.26 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  35.21 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  34.62 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  37.7 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2641  hypothetical protein  53.49 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3290  hypothetical protein  36 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0343638  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1505  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1112  hypothetical protein  35.29 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.220285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  42.59 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  31.43 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0221  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  43.24 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0145297  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>