31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2122 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  48.05 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  36.9 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  35.44 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  35.44 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  35.23 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  36.49 
 
 		 80 aa  51.2  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  32.89 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  32.88 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  32.89 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  31.33 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3290  hypothetical protein  32.58 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0343638  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  29.73 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  31.46 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  29.73 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  31.25 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  30.67 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  32.43 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  32.43 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  30.36 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  31.43 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  28.44 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  28.44 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  28.44 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  28.44 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  28.44 
 
 		 106 aa  42  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  45.65 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  45.65 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  42.22 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0721  hypothetical protein  34.85 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000996835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>