31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3438 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  215  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  84.4 
 
 
108 aa  168  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2641  hypothetical protein  71.03 
 
 
104 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  49.53 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  49.53 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  49.53 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  49.53 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  49.53 
 
 
106 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  56.25 
 
 
105 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0495  hypothetical protein  53.64 
 
 
104 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  54.95 
 
 
106 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  54.95 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  54.95 
 
 
106 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0520  hypothetical protein  54.13 
 
 
104 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.623296  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  48.6 
 
 
106 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  50.47 
 
 
106 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  49.53 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2791  hypothetical protein  52.34 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2644  hypothetical protein  32.29 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  51.43 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  44.26 
 
 
76 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  28.57 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  42.55 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3054  hypothetical protein  29.17 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  26.47 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  40.43 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  47.22 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  26.47 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0960  hypothetical protein  31.25 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  45.71 
 
 
76 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2962  hypothetical protein  23.91 
 
 
86 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>