16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3054 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3054  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2644  hypothetical protein  93.18 
 
 		 88 aa  165  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2809  hypothetical protein  63.22 
 
 		 86 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.873206  normal  0.133858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  32.29 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  35.44 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2641  hypothetical protein  29.03 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  27.84 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  32.32 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  29.17 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  31.25 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>