29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2641 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2641  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  213  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  71.03 
 
 
107 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  68.52 
 
 
108 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  45.28 
 
 
106 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  54.72 
 
 
105 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  50.45 
 
 
106 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  50.45 
 
 
106 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  49.55 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0520  hypothetical protein  50.96 
 
 
104 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.623296  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0495  hypothetical protein  50.96 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  43.4 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  44.34 
 
 
106 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2791  hypothetical protein  50.47 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227717  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2644  hypothetical protein  31.58 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  30.11 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0660  hypothetical protein  53.49 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3054  hypothetical protein  29.03 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  31.63 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  26.04 
 
 
90 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  43.18 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  23.86 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  34.69 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  28.89 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  44.74 
 
 
79 aa  40  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>