44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0495 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0495  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  207  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0520  hypothetical protein  97.12 
 
 		 104 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.623296  normal  0.300093 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  83.81 
 
 		 105 aa  140  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  76.42 
 
 		 106 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  77.36 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  77.36 
 
 		 106 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2791  hypothetical protein  77.45 
 
 		 102 aa  117  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3438  hypothetical protein  55.05 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0245703  hitchhiker  0.000378229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  63.27 
 
 		 106 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  62.24 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  59.09 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  58.18 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2641  hypothetical protein  53.77 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0518  hypothetical protein  50.45 
 
 		 108 aa  97.1  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.391783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  36.73 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11910  hypothetical protein  32.22 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.493836  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2644  hypothetical protein  40.82 
 
 		 88 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  28.87 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  35.11 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  60 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3054  hypothetical protein  36.17 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0621  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  30 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4549  hypothetical protein  29.03 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0667  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  45 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.575652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3290  hypothetical protein  35.05 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0343638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0661  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.277375  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60240  hypothetical protein  51.52 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  25.56 
 
 		 80 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4838  hypothetical protein  32.22 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442283  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5185  hypothetical protein  28.41 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0960  hypothetical protein  32.58 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0724  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  38.64 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  47.37 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0203  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  48.28 
 
 		 225 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.201113  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2241  hypothetical protein  54.84 
 
 		 89 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0158204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>