23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0040 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0040    100 
 
 		 2181 bp  4324    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.639312  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001105  1,4-alpha-glucan (glycogen) branching enzyme  80.99 
 
 		 2247 bp  115  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04851  glycogen branching enzyme  82.28 
 
 		 2229 bp  91.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1248  glycogen branching enzyme  92.16 
 
 		 2238 bp  69.9  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1463  1,4-alpha-glucan branching enzyme  85.19 
 
 		 2196 bp  65.9  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3028  glycogen branching enzyme  90.38 
 
 		 2232 bp  63.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.938358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1331  glycogen branching enzyme  90.38 
 
 		 2232 bp  63.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1357  glycogen branching enzyme  90.38 
 
 		 2232 bp  63.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.513069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1316  1,4-alpha-glucan branching enzyme  92.86 
 
 		 2187 bp  60  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18371  glycogen branching enzyme  100 
 
 		 2271 bp  60  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06401  glycogen branching enzyme  87.72 
 
 		 2268 bp  58  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.636304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0020  glycogen branching enzyme  87.72 
 
 		 2268 bp  58  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.663134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1321  glycogen branching enzyme  88.46 
 
 		 2232 bp  56  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.975501  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0117  glycogen branching enzyme  86.67 
 
 		 2190 bp  56  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2364  glycogen branching enzyme  94.29 
 
 		 2316 bp  54  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.056819 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0081  glycogen branching enzyme  96.77 
 
 		 2025 bp  54  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0612  1,4-alpha-glucan branching enzyme  87.04 
 
 		 1896 bp  52  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1636  glycogen branching enzyme  89.13 
 
 		 2190 bp  52  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.310271  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4006  glycogen branching enzyme  96.55 
 
 		 2184 bp  50.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4118  glycogen branching enzyme  96.55 
 
 		 2184 bp  50.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.595644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0147  glycogen branching enzyme  96.55 
 
 		 2184 bp  50.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01252  glycogen branching enzyme  91.89 
 
 		 2193 bp  50.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.369495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0987  glycogen branching enzyme  84.62 
 
 		 2190 bp  50.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0160232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>