31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04902 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04902  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000746  hemolysin  82.43 
 
 
81 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0538  hemolysin  52.44 
 
 
93 aa  97.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0124  hypothetical protein  39.24 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1383  putative hemolysin  34.67 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2083  hypothetical protein  34.67 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000368011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1903  putative hemolysin  34.67 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.238731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1367  putative hemolysin  34.67 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.603664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1400  putative hemolysin  34.67 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4771  hypothetical protein  31.46 
 
 
249 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2222  hypothetical protein  42.55 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0995  hypothetical protein  30.12 
 
 
87 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2046  putative lipoprotein  34.15 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2017  putative lipoprotein  35.14 
 
 
84 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00047259  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0898  hypothetical protein  42.55 
 
 
84 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01750  hypothetical protein  34.15 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01762  conserved outer membrane protein  34.15 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2271  hypothetical protein  40.74 
 
 
85 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.523223  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1840  hypothetical protein  35.14 
 
 
84 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310442  normal  0.289479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1379  hypothetical protein  34.21 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1850  protein of unknown function DUF333  34.15 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1879  putative lipoprotein  34.15 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1398  putative lipoprotein  34.15 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.115884  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1660  hypothetical protein  38.1 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2517  putative lipoprotein  34.15 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.678196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0104  hypothetical protein  32.94 
 
 
83 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.93756  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2198  protein of unknown function DUF333  42.55 
 
 
501 aa  44.7  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0979  protein of unknown function DUF333  34.38 
 
 
81 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00603291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0129  hypothetical protein  32.99 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000902821 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3072  hypothetical protein  32.69 
 
 
512 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570768  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0123  hypothetical protein  37.25 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0162016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>