55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2017 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2017  putative lipoprotein  100 
 
 
84 aa  174  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00047259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1398  putative lipoprotein  97.62 
 
 
84 aa  171  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.115884  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01762  conserved outer membrane protein  97.62 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01750  hypothetical protein  97.62 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2046  putative lipoprotein  97.62 
 
 
84 aa  170  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1850  protein of unknown function DUF333  96.43 
 
 
84 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1879  putative lipoprotein  96.43 
 
 
84 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1840  hypothetical protein  96.43 
 
 
84 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310442  normal  0.289479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2517  putative lipoprotein  95.24 
 
 
84 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.678196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2083  hypothetical protein  65.48 
 
 
83 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000368011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1903  putative hemolysin  64.29 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.238731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1367  putative hemolysin  64.29 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.603664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1400  putative hemolysin  64.29 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1383  putative hemolysin  64.29 
 
 
83 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1660  hypothetical protein  70.49 
 
 
80 aa  97.8  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0995  hypothetical protein  47.3 
 
 
87 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0135  hemolysin protein, putative  44.94 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0129  hypothetical protein  41.94 
 
 
98 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000902821 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0123  hypothetical protein  41.94 
 
 
98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0128  hypothetical protein  41.94 
 
 
98 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0128  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0132  protein of unknown function DUF333  48.44 
 
 
85 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4072  hypothetical protein  52.83 
 
 
83 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0719802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4226  hypothetical protein  48.44 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0133  hypothetical protein  48.44 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0124  hypothetical protein  40.24 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2222  hypothetical protein  53.06 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0104  hypothetical protein  40.24 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.93756  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0898  hypothetical protein  51.02 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1379  hypothetical protein  42.03 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2271  hypothetical protein  48.98 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.523223  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4771  hypothetical protein  39.29 
 
 
249 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000746  hemolysin  35.9 
 
 
81 aa  53.9  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04902  hypothetical protein  35.14 
 
 
86 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2199  hypothetical protein  34.94 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2321  hypothetical protein  34.94 
 
 
93 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0538  hemolysin  34.78 
 
 
93 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0995  hypothetical protein  34.12 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512791  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0221  hypothetical protein  43.55 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4187  protein of unknown function DUF333  47.17 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133356  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4299  protein of unknown function DUF333  47.17 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1256  hypothetical protein  31.17 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1248  hypothetical protein  31.17 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.302496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0778  hypothetical protein  31.17 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.994418  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1089  hypothetical protein  31.17 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1398  hypothetical protein  31.17 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.632309  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1871  hypothetical protein  31.58 
 
 
213 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.764601  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03138  proline rich transmembrane protein  44.07 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.497108  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5610  hypothetical protein  33.73 
 
 
128 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.937642 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1671  hypothetical protein  36.54 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0833154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2283  hypothetical protein  36.54 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.395959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2306  hypothetical protein  36.54 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1026  hypothetical protein  40.43 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  39.71 
 
 
201 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1095  hypothetical protein  35.59 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.383064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>