46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1400 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B1903  putative hemolysin  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.238731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1367  putative hemolysin  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.603664 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1400  putative hemolysin  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.173882 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1383  putative hemolysin  100 
 
 		 83 aa  173  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104622 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2083  hypothetical protein  98.8 
 
 		 83 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000368011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1398  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.115884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1840  hypothetical protein  64.29 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310442  normal  0.289479 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2017  putative lipoprotein  64.29 
 
 		 84 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00047259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1850  protein of unknown function DUF333  63.1 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1879  putative lipoprotein  63.1 
 
 		 84 aa  115  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01750  hypothetical protein  61.9 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428407  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2046  putative lipoprotein  61.9 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01762  conserved outer membrane protein  61.9 
 
 		 84 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2517  putative lipoprotein  61.9 
 
 		 84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.678196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1660  hypothetical protein  65.57 
 
 		 80 aa  94  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0995  hypothetical protein  43.53 
 
 		 87 aa  70.5  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4072  hypothetical protein  46.15 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1379  hypothetical protein  41.77 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0129  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000902821 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0124  hypothetical protein  43.59 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0123  hypothetical protein  43.55 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0162016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0128  hypothetical protein  37.63 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000259025 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0128  hypothetical protein  44.44 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0135  hemolysin protein, putative  40.32 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0132  protein of unknown function DUF333  42.59 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0133  hypothetical protein  42.59 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4226  hypothetical protein  42.59 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.998691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0104  hypothetical protein  38.37 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.93756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0538  hemolysin  31.51 
 
 		 93 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04902  hypothetical protein  34.67 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000746  hemolysin  29.49 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0898  hypothetical protein  41.79 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.966435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4771  hypothetical protein  33.72 
 
 		 249 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000131093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2271  hypothetical protein  45.1 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.523223  normal  0.11814 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2222  hypothetical protein  45.1 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0706  hypothetical protein  40.91 
 
 		 201 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1095  hypothetical protein  35.94 
 
 		 175 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.383064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0221  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2463  hypothetical protein  38 
 
 		 392 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2199  hypothetical protein  28.05 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2321  hypothetical protein  28.05 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1961  hypothetical protein  34.29 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0979  protein of unknown function DUF333  32.84 
 
 		 81 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00603291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0995  hypothetical protein  36 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.512791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1026  hypothetical protein  36.96 
 
 		 152 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2221  hypothetical protein  29.76 
 
 		 114 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00766723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>