26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00592 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00592  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  383  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001901  hypothetical protein  93.12 
 
 
213 aa  357  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291839  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4620  hypothetical protein  61.38 
 
 
215 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0300  hypothetical protein  61.29 
 
 
215 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.526275  hitchhiker  0.000000110588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3911  hypothetical protein  59.79 
 
 
215 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0329  hypothetical protein  58.51 
 
 
215 aa  235  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.14271  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0314  hypothetical protein  59.14 
 
 
217 aa  234  4e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3710  hypothetical protein  59.14 
 
 
217 aa  234  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.147612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0309  hypothetical protein  59.14 
 
 
217 aa  234  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.177361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0318  hypothetical protein  58.6 
 
 
217 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0313  hypothetical protein  58.6 
 
 
217 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0312  hypothetical protein  58.6 
 
 
217 aa  233  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0317  hypothetical protein  58.6 
 
 
217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3547  hypothetical protein  57.53 
 
 
216 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.870565  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4403  hypothetical protein  58.06 
 
 
222 aa  230  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3406  hypothetical protein  57.38 
 
 
217 aa  228  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03527  glutamine synthetase  59.46 
 
 
212 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000263621  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3450  hypothetical protein  56.91 
 
 
215 aa  227  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168416  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3953  hypothetical protein  55.14 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1412  hypothetical protein  51.08 
 
 
216 aa  208  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.801363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0988  DNA repair ATPase  48.4 
 
 
217 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  hitchhiker  0.00727028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0761  hypothetical protein  46.24 
 
 
215 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000010491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15390  hypothetical protein  47.85 
 
 
215 aa  184  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0448469  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2063  hypothetical protein  47.31 
 
 
212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0236211  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0520  hypothetical protein  47.59 
 
 
236 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2822  hypothetical protein  32.14 
 
 
213 aa  77  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>