26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3953 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3953  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03527  glutamine synthetase  66.35 
 
 		 212 aa  295  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000263621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3911  hypothetical protein  61.32 
 
 		 215 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0300  hypothetical protein  61.32 
 
 		 215 aa  266  1e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.526275  hitchhiker  0.000000110588 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3547  hypothetical protein  58.02 
 
 		 216 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.870565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0329  hypothetical protein  62.05 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.14271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4620  hypothetical protein  58.96 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0314  hypothetical protein  56.07 
 
 		 217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0318  hypothetical protein  57.08 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3710  hypothetical protein  56.07 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.147612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0309  hypothetical protein  56.07 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0313  hypothetical protein  57.08 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0312  hypothetical protein  57.08 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0317  hypothetical protein  57.08 
 
 		 217 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4403  hypothetical protein  55.61 
 
 		 222 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3406  hypothetical protein  59.28 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3450  hypothetical protein  58.97 
 
 		 215 aa  241  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001901  hypothetical protein  52.38 
 
 		 213 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291839  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1412  hypothetical protein  51.28 
 
 		 216 aa  218  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00592  hypothetical protein  55.14 
 
 		 189 aa  212  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15390  hypothetical protein  45.24 
 
 		 215 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0448469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0988  DNA repair ATPase  48.73 
 
 		 217 aa  199  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  hitchhiker  0.00727028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2063  hypothetical protein  44.93 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0236211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0761  hypothetical protein  41.43 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000010491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0520  hypothetical protein  45.54 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2822  hypothetical protein  29.61 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>