26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2063 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2063  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0236211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0761  hypothetical protein  73.58 
 
 
215 aa  330  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000010491  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15390  hypothetical protein  51.9 
 
 
215 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0448469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0988  DNA repair ATPase  54.08 
 
 
217 aa  218  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  hitchhiker  0.00727028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1412  hypothetical protein  52.79 
 
 
216 aa  217  8.999999999999998e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.801363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3911  hypothetical protein  46.12 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001901  hypothetical protein  48.79 
 
 
213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291839  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0329  hypothetical protein  47.45 
 
 
215 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.14271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4620  hypothetical protein  45.45 
 
 
215 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4403  hypothetical protein  45.02 
 
 
222 aa  206  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0313  hypothetical protein  45.02 
 
 
217 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0312  hypothetical protein  45.02 
 
 
217 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849296  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0317  hypothetical protein  45.02 
 
 
217 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0318  hypothetical protein  45.02 
 
 
217 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0300  hypothetical protein  43.27 
 
 
215 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.526275  hitchhiker  0.000000110588 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0314  hypothetical protein  44.08 
 
 
217 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3406  hypothetical protein  46.43 
 
 
217 aa  202  3e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03527  glutamine synthetase  46.45 
 
 
212 aa  202  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000263621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0309  hypothetical protein  44.08 
 
 
217 aa  202  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.177361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3710  hypothetical protein  44.08 
 
 
217 aa  202  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.147612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3547  hypothetical protein  45.73 
 
 
216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.870565  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3953  hypothetical protein  44.93 
 
 
212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00592  hypothetical protein  47.31 
 
 
189 aa  183  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0520  hypothetical protein  45.96 
 
 
236 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3450  hypothetical protein  42.78 
 
 
215 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168416  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2822  hypothetical protein  26.32 
 
 
213 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>