26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_15390 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_15390  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0448469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1412  hypothetical protein  54.82 
 
 
216 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.801363  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2063  hypothetical protein  51.9 
 
 
212 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0236211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001901  hypothetical protein  47.87 
 
 
213 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291839  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0988  DNA repair ATPase  53.33 
 
 
217 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.382844  hitchhiker  0.00727028 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3911  hypothetical protein  47.42 
 
 
215 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03527  glutamine synthetase  48.34 
 
 
212 aa  208  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000263621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0761  hypothetical protein  47.62 
 
 
215 aa  208  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000010491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0314  hypothetical protein  44.95 
 
 
217 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3710  hypothetical protein  44.95 
 
 
217 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.147612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0309  hypothetical protein  44.95 
 
 
217 aa  201  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.177361 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3953  hypothetical protein  45.24 
 
 
212 aa  201  7e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4403  hypothetical protein  44.5 
 
 
222 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0300  hypothetical protein  45.67 
 
 
215 aa  199  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.526275  hitchhiker  0.000000110588 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0329  hypothetical protein  44.9 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.14271  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0312  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.849296  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0313  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0318  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0317  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3547  hypothetical protein  43.46 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.870565  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4620  hypothetical protein  44.39 
 
 
215 aa  194  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0520  hypothetical protein  48.37 
 
 
236 aa  194  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3406  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3450  hypothetical protein  44.62 
 
 
215 aa  187  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.168416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00592  hypothetical protein  47.85 
 
 
189 aa  184  7e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2822  hypothetical protein  33.52 
 
 
213 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>