90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002435 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002435  PTS system cellobiose-specific IIB component  100 
 
 		 86 aa  176  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03625  hypothetical protein  89.53 
 
 		 101 aa  160  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0900  PTS system, cellobiose-specific IIB component  87.21 
 
 		 101 aa  157  6e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3754  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  54.76 
 
 		 100 aa  94  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5331  PTS system, cellobiose-specific IIB component  51.19 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5321  PTS system, cellobiose-specific IIB component  51.19 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5444  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  51.19 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4904  PTS system, lichenan-specific IIB component  51.19 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5059  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  51.19 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5628  PTS system, cellobiose-specific IIB component  51.19 
 
 		 100 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000651969 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4889  PTS system,lichenan-specific IIB component (phosphotransferase system protein)  51.19 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5376  PTS system, cellobiose-specific IIB component  51.19 
 
 		 100 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5004  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  48.81 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0704  PTS system, cellobiose-specific component IIB  46.51 
 
 		 101 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0200  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  47.06 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.572333  normal  0.0247781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0008  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  47.06 
 
 		 101 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4224  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  42.35 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.211197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0009  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  47.06 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3348  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  46.51 
 
 		 101 aa  78.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0038  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  44.71 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.58538  normal  0.572233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5326  PTS system, cellobiose-specific IIB component  45.24 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5623  PTS system, cellobiose-specific IIB component  44.05 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000565643 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5383  PTS system, cellobiose-specific IIB component  44.05 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5007  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  45.12 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5449  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  44.05 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5305  PTS system, cellobiose-specific IIB component  44.05 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000478718 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4909  PTS system, cellobiose-specific IIB subunit  44.05 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4896  PTS system, cellobiose-specific IIB subunit  44.05 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5064  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  44.05 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5336  PTS system, cellobiose-specific IIB component  41.67 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0028  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  40 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2134  PTS system, lactose/cellobiose family IIB subunit  40.48 
 
 		 100 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  36.47 
 
 		 107 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3467  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  40 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0738  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  40 
 
 		 105 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234762  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0329  PTS system, cellobiose-specific IIB component  42.35 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0210204  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1855  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.65 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1053  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  44.19 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.586285  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0194  cellobiose-specific PTS system IIB component  42.05 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.173485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1659  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  33.72 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0329869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0685  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  45.24 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0769545  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2670  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  41.86 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B06  chitibiose transporter protein chbB  36.05 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3049  PTS system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.82 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2493  PTS system, lactose/cellobiose-specific IIB component  39.53 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0758  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  36.67 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.560408  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2199  putative cellobiose phosphotransferase enzyme IIB component  38.37 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.709039  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0332  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.9 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0264  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  36.9 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1633  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  43.18 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.640995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0533  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.94 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0465  cellobiose-specific PTS system IIB component  39.56 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00433056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1620  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  43.18 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0607362  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1257  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.94 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2602  PTS system, IIB component  39.76 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1617  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.09 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1739  PTS system lactose/cellobiose family IIB subunit  42.05 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.467049  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0198  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.33 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0845  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.29 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0701  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.29 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4491  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.29 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000137103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2272  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.15 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0288609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0885  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.29 
 
 		 87 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.200420000000001e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0688  PTS system, cellobiose-specific IIB component  35.29 
 
 		 101 aa  52  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2417  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  28.74 
 
 		 101 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0753  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  34.12 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0792  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  34.12 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3521  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29.11 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.403292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2495  PTS system, cellobiose-specific IIB component, putative  30.23 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.116089  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0338  cellobiose-specific PTS system IIB component  37.93 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2913  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  28.74 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.609986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2558  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  30.23 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0883  PTS system, cellobiose-specific IIB component  34.12 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2290  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  29.07 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.4303  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2479  putative PTS system, cellobiose-specific IIB component  29.07 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1202  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.18 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2253  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIB component  29.07 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2462  PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIB  29.07 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0223  cellobiose-specific PTS system IIB component  33.33 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.981208  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1208  cellobiose-specific PTS system IIB component  33.33 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.745209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0703  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.94 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2211  PTS system, diacetylchitobiose-specific IIB component  29.07 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0954  PTS system, cellobiose-specific IIB component  34.52 
 
 		 87 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0080  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.88 
 
 		 98 aa  47  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2269  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.316995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1585  cellobiose phosphotransferase system IIB component  32.58 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1789  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  26.44 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5300  PTS system, cellobiose-specific IIB component  50 
 
 		 41 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000264325 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0939  cellobiose-specific PTS system IIB component  25 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.716302  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0928  cellobiose phosphotransferase system IIB component  32.39 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>